当方、下記の環境で検証しましたが、正しく動作しました。
なにかカスタマイズしていませんか？

WordPress 4.7
Twenty Twelve 2.2

スタイルで非表示にできないのであれば、テンプレートを編集してタイトルそのものを出力しないようにするのではどうでしょうか？

content.php（抜粋）

<?php if ( is_single() ) : ?>
<h1 class="entry-title"><?php the_title(); ?></h1>
<?php else : ?>

を、

<?php if ( is_single() ) : ?>
<?php /* <h1 class="entry-title"><?php the_title(); ?></h1> */ ?>
<?php else : ?>

のようにコメントアウトしてみてはどうでしょうか。