kwebble_archives_by_cat という Plugin で、「アーカイブページでの条件分岐」できませんが、「アーカイブページで、カテゴリーで出力を制限」はできます。
kwebble_archives_by_catここからプラグインをダウンロードできます。
通常の、wp_get_archives の引数に加え、カテゴリの指定(制限)ができます。月別アーカイブや最近のアーカイブはうまくいっていたような気がします。
年別アーカイブ・週別アーカイブあたりの動作があやしかった記憶がありますが・・。
Sample
<?php wp_get_archives('cat=1'); ?>
The same list, but with posts from categories 1 and 3:
<?php wp_get_archives('cat=1,3'); ?>
Use posts from all categories except category 2:
<?php wp_get_archives('cat=-2'); ?>
Use posts from all categories except categories 2 and 8:
<?php wp_get_archives('cat=-2,-8'); ?>
Advanced Category Excluder の解説というのもあります(使ったことはありません)。
『Advanced Category Excluder』は、特定カテゴリの記事を、非表示にすることが出来るプラグインです。トップ・アーカイブ・Feed・検索結果のページ上にて、非表示に出来ます。
とあります。