インデックスされない

SEOに関する質問には残念ながらフォーラム違いなのでお答えできません。
やほおに関するインデックスならyahoo!サイトエクスプローラーを使用すれば解決するかもしれません。

それとサイトを開いたとき真っ白な画面になったり、サーバーエラー500になったりして表示しない時があります。(再読み込みすると表示されます。)

どちらのサーバーをお使いなのでしょうか？サーバーが不安定なのではないと確信できるのであればDBのお掃除をしてみるのも手かもしれません。われらがをかもとさん作Table optimizerで定期的にオーバーヘッドをクリーンにすると幸せになれるかもしれません。お勧めです;)

こちらがなにか関係しているのでしょうか？
サーバーに問題があるのでしょうか？

クローラーがアクセスした時に500エラー頻発だとすれば関係あるかもしれませんね･･･

数日前も同じ質問がありましたので利用の際は十分検索してください。

まあ今後はYahoo検索エンジンはGoogle検索となるので心配の必要はないでしょうけど。