カスタマイザーの設定が移設時にデフォルトに戻る

WordPress環境移設に際し、テーマオプションやカスタマイザで管理画面から設定した情報だけがデフォルトに戻るという事象を目にしました。幾つかの環境で試したところ、問題なく設定が保持される移設先環境もあります。
問題の起こる環境でも、DB内のURLの置換は成功していると考えられ、ページのリンク関係、固定ページや投稿からの画像の呼び出しはうまくいっています。DebugモードでもPHPのエラーは出ていません。

私はこれまでテーマの自作や直接改変による構築ばかりを少々していてカスタマイザをほとんど使ったことがなく、よく分からないのですが、設定した情報はDBのoptionのテーブルに入っているという理解でいいのでしょうか。そこだけデータが読み出せなくなるのには、どんな事情が考えられますか。
何か理解のヒントになる情報をいただけましたら幸いです。