カスタムタクソノミーのアーカイブページで記事が出てこない

カスタムタクソノミーのアーカイブページで記事が表示されなくて困っています。どうかおたすけくださいm(_ _)m

Toolset Typesを使って、通常の投稿(post)にカスタムタクソノミーを追加しました。タクソノミー名はsubcateです。

Show Current Templateを入れてどのテンプレートが読み込まれているか確認したところ、http://example.com/subcate/term1/にアクセスすると、archive-custom.phpという他のカスタム投稿で使っているテンプレートが読み込まれていました。

まずこの時点で挙動がおかしいと思うのですが、気を取り直してtaxonomy-subcate.phpというファイルを作ったら、カスタムタクソノミーのアーカイブではtaxonomy-subcate.phpが読み込まれるようになりました。

ただ、実際には複数の記事が存在しているはずなのに何も出てきません。ループでは特に特別なことはしていないと思うのですが、記事が出てきてくれなくて困っています。

<?php
if ( have_posts() ) :
while(have_posts()): the_post();
?>
<h2>
  <a href="<?php the_permalink(); ?>"><?php echo get_the_title(); ?></a>
</h2>
<?php
endwhile;
endif;
?>

ネットで調べると、カスタム投稿の設定が問題とか、スラッグが被っているといったことは出てくるのですが、カスタムタクソノミーを追加したのは通常の投稿ですし、スラッグも被っていません。本当ハマりにハマっています。

なお、苦肉の策で下記のように条件をWP_Queryでループを書いてみたところ、一応記事は出てきますが、今度は2ページが404 Not Foundになってしまいました。八方塞がりです(:o;)

<?php
$paged = (get_query_var('paged')) ? get_query_var('paged') : 1;
$args = array(
  'paged' => $paged,
  'post_type' => array('post'),
  'tax_query' => array(
    array(
      'taxonomy' => 'subcate',
      'field' => 'slug',
      'terms' => $term,
    ),
  ),
);
$wp_query = new WP_Query($args);
if ( have_posts() ) :
?>
<h2>
  <a href="<?php the_permalink(); ?>"><?php echo get_the_title(); ?></a>
</h2>
<?php
endwhile;
endif;
?>

何か考えられる原因や対処法がありましたら、ご教示いただけると幸いです。
よろしくお願いいたします。