カスタムフィールドの表示順を固定したい

ID 順でよければ、WordPress のバージョンを新しくすると、そうなります。検証サーバーを用意して試してみてください。

get_metadata 関数が返すカスタムフィールドの並び順を WordPress 2.9 と 4.2.4 とで比較すると、2.9 では決まりがない（並び順が変わることがある）のに対して、4.2.4 では一定の順（カスタムフィールドの ID 順）に並びます。これは、カスタムフィールドを取得する get_metadata 関数の中で実際にデータベースへクエリを発行している update_meta_cache 関数の処理内容が、2.9 と 4.2.4 とで違うためです。

2.9 の場合：

$meta_list = $wpdb->get_results( $wpdb->prepare("SELECT $column, meta_key, meta_value FROM $table WHERE $column IN ($id_list)",
	$meta_type), ARRAY_A );

4.2.4 の場合：

$id_column = 'user' == $meta_type ? 'umeta_id' : 'meta_id';
$meta_list = $wpdb->get_results( "SELECT $column, meta_key, meta_value FROM $table WHERE $column IN ($id_list) ORDER BY $id_column ASC", ARRAY_A );