カスタムメニューに関しての質問です。

使用環境
WordPress 3.12（ローカル）
ブラウザ：firefox 4

ローカル
・Apache 2.2.17
・MySQL 5.5.8
・PHP 5.3.5
・phpMyAdmin 3.3.9

ワードプレスでポートフォリオサイトを構築しようとしています。
その際グローバルナビゲーションを

・home
・ポートフォリオ
・ブログ
・コンタクト

で作成しようとしています。
また・homeは固定ページにする為、home.phpで作成し、ブログはindex.phpに、ポートフォリオとコンタクトはそれぞれ固定ページを作成し、テンプレートを選択しました。

その上でカスタムメニューを選択しましたが、home.phpやindex.phpはどのようにしてカスタムメニューで選択すれば良いのでしょうか？

また、以上の条件のナビゲーションをカスタムメニューではなく作成する場合固定ページなどへのリンクはどのように構築すればよいのでしょうか？
よろしくご支援お願いします。