コメント欄の表示と非表示切り替えに関して

こんにちは。

WordPress2.9.2 を利用しています。
コメント欄の表示、非表示の切り替えに関してアドバイスを頂きたいと思います。

ダッシュボード：設定：ディスカッション設定
投稿のデフォルト設定
□他のブログからのリンク通知を許可する (ピンバックとトラックバック)
□新しい投稿へのコメントを許可する

にチェックが入っています。

この状態で新規記事を作成すれば、コメント欄及びトラックバックのURLが表示されています。

他の設定は基本のままです。

ただ、過去の記事でコメント欄及びトラックバックのURLが表示されなくなっています。
過去の記事での設定は

ダッシュボード：投稿：編集
該当記事の「編集」をクリック
「ディスカッション」にて
□コメントの投稿を許可する。
□このページで トラックバック・ピンバックを許可する。
にチェックを入れ「更新」ボタンを押しても、記事に反映されません。
過去の記事で、コメント欄の表示、非表示は切り替える事が出来ないのでしょうか。

また、過去の記事で上記「ディスカッション」の項目にチェックが入っているにも関わらず、コメント欄とトラックバクのURLが表示していません。
コメントが付いている記事でも、今はコメント欄が表示されていません。

他の情報
パーマリンクの設定は「デフォルト」です。
記事を作成した当時は「数字ベース」になっていたかも知れません。

WordPress は多分2.8位からダッシュボードで更新のお知らせがあったら、自動更新をしていました。
今回、問題の切り分けの為、WordPress2.9.2 を新たに1式ダウンロードして、全てのファイルを入れ替えてみましたが改善しません。
確認したテーマは default です。問題に気がついた時は自作テーマでした。

本日新規に作成した記事は、記事の編集欄でコメントに関して、チェックのオン・オフで表示、非表示の切り替えが出来ますが、過去の記事ではコメント欄が表示出来なくなっています。

原因に何か心当たりは無いでしょうか、アドバイスを頂けると幸いです。