タクソノミーの階層構造内 "子"に属している記事の表示

[ 使用しているwordpressのバージョン ]
・wp 4.0
・Custom Post Type UI version: 0.8.5
・Custom Post Type Permalinks

—

現在、上記を使用しカスタム投稿タイプを設置し、そのなかでタクソノミーをカテゴリのようにして構築しています。

[カスタム投稿 A]
　ー親カテゴリ01
　　　ー小カテゴリ001
　　　ー小カテゴリ002
　ー親カテゴリ02
　　　ー小カテゴリ003
　　　ー小カテゴリ004

といった形です。

記事自体は、親カテゴリのみに属している場合と子カテゴリに属している場合があります。
その際に、親カテゴリに属している記事は正常に表示されていますが、子カテゴリに属している記事がindex.phpテンプレートが表示されてしまっています。

https://ja.forums.wordpress.org/topic/8802?replies=6

こちらの記事も閲覧し、同様の問題かとも思うのですが↑が解決済みではなく、funcitons.phpに記述をしても表示されていないのでご相談させてください！

—

テンプレートは、
single-カスタム投稿A.phpが親カテゴリの記事を表示しています。
同様に、taxonomyなども試しているのですがダメです。。。

URLが正常に表示はされているので、どうしたものかと考えあぐねています！

どうすればいいのでしょうか。

よろしくおねがいします。