テンプレート制作中の日本語について

きのうから触り始めた初心者です。
識者の方々、どうぞよろしくお願いいたします。

役に立つがどうかわかりませんが、
MTは長い事関わっていますので、その程度のスキルだとご判断ください。
phpは書けません。
きのうからなので、wordpressタグはひとつもわかりませんが、
試行錯誤している最中といったところです。

インストールはスムーズにいき、まずはテンプレートを編集しているところです。
ものすごい初歩で恐縮ですが、日本語を入れてアップすると、文字がでません。（？？？？と文字化けしています）
管理画面（テーマエディタ）からの日本語入力は、意図通りテンプレートに反映されます。
MTではこういうことがないので、phpファイルをいじる上での仕様だと思いますが、
これを管理画面（テーマエディタ）を介さずに日本語をテンプレートに反映する方法はないものでしょうか。

実体参照に変換した文字ならFTPでもそのまま反映されますが、視認性に欠けます。
日本語を入れる度に管理画面からの編集を強いられるのが、
通常のwordpressによるページ制作のフローなのでしょうか。。。

不明点などございましたら、なんなりとご質問ください。