パーマリンク設定によってトップページ以外表示しない

ご返答ありがとうございます。
ドメイン直下にindex.phpは作成しており、記述についても「/wp/wp-blog-header.php」となっております。
下記がドメイン直下の記述内容になります。

<?php
/**
 * Front to the WordPress application. This file doesn't do anything, but loads
 * wp-blog-header.php which does and tells WordPress to load the theme.
 *
 * @package WordPress
 */

/**
 * Tells WordPress to load the WordPress theme and output it.
 *
 * @var bool
 */
define('WP_USE_THEMES', true);

/** Loads the WordPress Environment and Template */
require( dirname( __FILE__ ) . '/wp/wp-blog-header.php' );

さくらサーバー自体の問題なども考えられたりするのでしょうか？
また、質問文には記載しておりませんでしたが。SSL対応のため下記の記述を各.htaccessとwp-config.phpに記述しております。

■ドメイン直下.htaccess（現在のパーマリンク設定は基本）

RewriteEngine On 
RewriteCond %{HTTP_HOST} ^(www\.)?example\.sakura\.ne\.jp$ [NC] 
RewriteRule .* https://example.com%{REQUEST_URI} [R=301,L]

RewriteEngine On
RewriteCond %{HTTP:X-Sakura-Forwarded-For} ^$
RewriteRule ^(.*)$ https://example.com/$1 [R=301,L]

# BEGIN WordPress
<IfModule mod_rewrite.c>
RewriteEngine On
RewriteBase /
RewriteRule ^index\.php$ - [L]
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d
RewriteRule . /index.php [L]
</IfModule>

# END WordPress

■「wp」ディレクトリ内.htaccess

RewriteEngine On 
RewriteCond %{HTTP_HOST} ^(www\.)?example\.sakura\.ne\.jp$ [NC] 
RewriteRule .* https://example.com%{REQUEST_URI} [R=301,L]

RewriteEngine On
RewriteCond %{HTTP:X-Sakura-Forwarded-For} ^$
RewriteRule ^(.*)$ https://example.com/$1 [R=301,L]

# BEGIN SAKURA Internet Inc.
<IfModule mod_deflate.c>
SetOutputFilter DEFLATE
AddOutputFilterByType DEFLATE text/css
AddOutputFilterByType DEFLATE application/x-javascript application/javascript application/ecmascript
</IfModule>
<IfModule mod_expires.c>
ExpiresActive On
<FilesMatch “\.(css|js)$”>
ExpiresDefault “access plus 1 week”
</FilesMatch>
<FilesMatch “\.(gif|jpe?g|png)$”>
ExpiresDefault “access plus 1 month”
</FilesMatch>
</IfModule>
# END SAKURA Internet Inc.

# BEGIN WordPress
<IfModule mod_rewrite.c>
RewriteEngine On
RewriteBase /wp/
RewriteRule ^index\.php$ – [L]
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d
RewriteRule . /wp/index.php [L]
</IfModule>

# END WordPress

■wp-config.phpに追記

if( isset($_SERVER['HTTP_X_SAKURA_FORWARDED_FOR']) ) {
    $_SERVER['HTTPS'] = 'on';
    $_ENV['HTTPS'] = 'on';
    $_SERVER['HTTP_HOST'] = 'example.com';
    $_SERVER['SERVER_NAME'] = 'example.com';
    $_ENV['HTTP_HOST'] = 'example.com';
    $_ENV['SERVER_NAME'] = 'example.com';
}

ご返答ありがとうございます。
ドメイン直下内の「.htaccess」に記載しておりました下記コードが原因だったようです。
ですが、サイト公開時から入れていたはずなので突然リダイレクトするようになったのが、まだ謎です。

RewriteEngine On 
RewriteCond %{HTTP_HOST} ^(www\.)?example\.sakura\.ne\.jp$ [NC] 
RewriteRule .* https://example.com%{REQUEST_URI} [R=301,L]

RewriteEngine On
RewriteCond %{HTTP:X-Sakura-Forwarded-For} ^$
RewriteRule ^(.*)$ https://example.com/$1 [R=301,L]