パーマリンク設定をデフォルト以外にするとホームページ以外表示できな

WordPress 3.3.2–ja を使っています。
インストール直後の状態では正常に表示されます。
変更したのはパーマリンクの設定のみで、
これをデフォルト以外にすると、

例えば、サンプルページのリンクをクリックすると

IE、Chrome Beta、Opera では
ファイル(0バイト)のダウンロードになってしまいます。

Firefox Beta、Safari では正常にページが表示されます。

ブラウザはいずれも最新版です。
どうすれば直るのか分からず困っています。

.htaccess の内容は

# BEGIN WordPress
<IfModule mod_rewrite.c>
RewriteEngine On
RewriteBase /
RewriteRule ^index\.php$ – [L]
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d
RewriteRule . /index.php [L]
</IfModule>

# END WordPress

です。またサーバはさくらのVPSです。

httpd -V は

Server version: Apache/2.2.15 (Unix)
Server built: Feb 13 2012 22:31:42
Server’s Module Magic Number: 20051115:24
Server loaded: APR 1.3.9, APR-Util 1.3.9
Compiled using: APR 1.3.9, APR-Util 1.3.9
Architecture: 64-bit
Server MPM: Prefork
threaded: no
forked: yes (variable process count)
Server compiled with….
-D APACHE_MPM_DIR=”server/mpm/prefork”
-D APR_HAS_SENDFILE
-D APR_HAS_MMAP
-D APR_HAVE_IPV6 (IPv4-mapped addresses enabled)
-D APR_USE_SYSVSEM_SERIALIZE
-D APR_USE_PTHREAD_SERIALIZE
-D SINGLE_LISTEN_UNSERIALIZED_ACCEPT
-D APR_HAS_OTHER_CHILD
-D AP_HAVE_RELIABLE_PIPED_LOGS
-D DYNAMIC_MODULE_LIMIT=128
-D HTTPD_ROOT=”/etc/httpd”
-D SUEXEC_BIN=”/usr/sbin/suexec”
-D DEFAULT_PIDLOG=”run/httpd.pid”
-D DEFAULT_SCOREBOARD=”logs/apache_runtime_status”
-D DEFAULT_LOCKFILE=”logs/accept.lock”
-D DEFAULT_ERRORLOG=”logs/error_log”
-D AP_TYPES_CONFIG_FILE=”conf/mime.types”
-D SERVER_CONFIG_FILE=”conf/httpd.conf”

httpd -M は

Loaded Modules:
core_module (static)
mpm_prefork_module (static)
http_module (static)
so_module (static)
auth_basic_module (shared)
authn_file_module (shared)
authn_default_module (shared)
authz_host_module (shared)
authz_default_module (shared)
log_config_module (shared)
logio_module (shared)
env_module (shared)
expires_module (shared)
deflate_module (shared)
headers_module (shared)
setenvif_module (shared)
mime_module (shared)
dir_module (shared)
alias_module (shared)
rewrite_module (shared)
cache_module (shared)
disk_cache_module (shared)
cgi_module (shared)
evasive20_module (shared)
php5_module (shared)
ssl_module (shared)
Syntax OK

php -v は

PHP 5.3.3 (cli) (built: May 7 2012 20:13:47)
Copyright (c) 1997-2010 The PHP Group
Zend Engine v2.3.0, Copyright (c) 1998-2010 Zend Technologies

です。

どうぞよろしくお願いします。