パーマリンク設定変更時の対応：.htaccessの更新とは？

Zymicというレンタルサーバーへインストールしたのですが、パーマリンク設定を変更しようとしたところ、

.htaccess を更新する必要があります。

という警告文が出てきました。

ページの下の方に

あなたの .htaccess が書き込み可能ならこの操作は自動的に行われますが、そうでない場合は .htaccess ファイルに mod_rewrite ルールを書き込む必要があります。このフィールドをクリックし、CTRL + a ですべてのコードを選択してください。

<IfModule mod_rewrite.c>
RewriteEngine On RewriteBase /
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d
RewriteRule . /index.php [L]
</IfModule>

との文言があったため、
.htaccessを秀丸で開いて上記をコピペし、FFFTPで元に位置に戻してあげましたが、うまくいきませんでした。

対処方法をご教示ください。