フィード出力が無効状態に

カテゴリーベースのデフォルト値は、categoryです。タグベースのデフォルト値は、tagです。値を変更することはできますが、取り除くことはできません。
ということですけど、確認されましたか？

こんにちは、
前回、HTTP406の旨　ご連絡させていただきました。
その後、気には、なっていたのですが、だめもとでよろしければ、ご検討ください。

その1　406は解消したのか

test1
http://www.seotoools.com/htmllint/htmllint.html
にアクセスし、
http://blog.tokeidai.net/feed/　
をレスポンスヘッダを表示する設定で検査
406　リクエスト不受理になります。

test2
ローカルコンピュータから、php関数を使ってレスポンスをチェックする

<?php
$url = 'http://blog.tokeidai.net/feed/';

if (!$fp = fopen($url, 'r')) {
    trigger_error("Unable to open URL ($url)", E_USER_ERROR);
}

$meta = stream_get_meta_data($fp);

print_r($meta);

fclose($fp);
?>

結果は、

array (
  'wrapper_data' =>
  array (
    0 => 'HTTP/1.1 200 OK',
    1 => 'Date: Sun, 14 Nov 2010 00:36:10 GMT',

となりました。

何ででしょうかね?

このことから推定すると、
1　ワードプレスの上位ディレクトリに.htaccessなどで、直接リンクを禁止する設定などが行われている。
2　apacheのモジュールが悪さをしている。

3　ほかにも、インストールに失敗しているとか、ファイルをチェックするために、FTPで古いファイルを新しいファイルに上書きしたとか、さまざまありそうでなんともいえないのですが、

1　調べてみては、どうでしょうか
2　WordPress　406といえば、mod_securityみたいなのが、WEBにいっぱいあります。だめもとで、やってみてはどうでしょうか？
WordPressの.htaccessに追記

<IfModule mod_security.c>
SecFilterEngine Off
SecFilterScanPOST Off
</IfModule>

3　データベースにアクセスできるなら、optionsテーブル内で、_transient_feed_***** というフィールドを探してみてください。ここにrssフィード本体があるはずなので、これが空だったりしたらフィードも出ない（やったことないですけど）かも

ほか、
feedの　mimetype　が、text/htmlの件ですが、
たとえば、XREAサーバなどでは、phpをcgiモードで動作させると強制的に、text/htmlになるようなことがあります。
問題のフィードは、htmllintで、type application/x-httpd-phpcgiで動作していると表示されているのですが、
cgiモードで動作させる設定も調べてみたほうがいいかもしれないです。