ページは閲覧可能ですが、全てのページに404が表示される

WordPress、HP管理初心者です。
用語など調べながら原因を探していますので間違いなどありましたらご指摘ください。

勤め先のHPに出現するようになった、
404 Not Foundの症状に悩まされています。
似た症例をなかなか探すことができず困っています、ご教示ください。

状況は以下の通りです。

・WordPress4.0-ja(現在)
・サーバーはheteml PHP5.4　使用
・2014年4月頃のWordPressのバージョンアップ後起こるようになった
・デザイナーに制作してもらったテーマ使用ですが、制作者とは諸事情で連絡がとれません。
・トップページ含め全てのページが閲覧は可能。
・全てをまわることができてもおかしな点
　　・通常は背景は白に設定していますが、このエラーになっているときは背景が青く、　　　　ところどころ文字色も変わっています。　
　　・常に左下に
　　　「404　Not　Found　The server can not find the requested page・・・・」
　　　と表示があります。
・設定している404エラーのページではありません。
・リンクの誤りがあったときは設定どおりの404エラーのページにとびます。
・このエラーが出ても、数日後には通常通りに戻っていることがありました。
・このエラーが出るようになるまで、WordPress上のみで管理しており、heteml内のphp(?
)などは書きかえたことはありません。

以上です。
宜しくお願い致します。