再インストールで古いdbテーブルを削除するには？

再インストールする必要はありません。
この方法を試してみてください。

解りづらい場合は手前味噌ですが、設置ディレクトリと違うディレクトリでの運用など参考になれば。

htaccessはパーマリンクを一度も変えていなければ存在しないかもしれません。
一度パーマリンクを変更して（すぐ元に戻して）みたら作成されるかもしれません。
しかし、サーバの設定で自動生成ができない場合があります。その場合はパーマリンクを変更したとき下に表示されるコードをコピーして手動でhtaccessファイルを作成してください。

古いDBを削除するのに一番手っ取り早いのはMySQLを削除し新たに作成することです。当然同じMySQLを使っている他のものがあれば、そのデータも削除されます。

次に楽なのはwp-config.phpの中にある、データベーステーブルの接頭語を変えてやることになります（正確にはMySQLの中に古いデータが残ったままになります）。つまり、
$table_prefix = 'wp_';
これを適当な文字に変えてやると、元のデータにはアクセスしなくなります（必要な時に戻せるというメリットがある）。例えば：
$table_prefix = 'wp2_';
とかやれば良いということです。

一番面倒なのは、MySQLを何らかのツールを使って手動でテーブルひとつずつ削除する方法です。目的のものだけを削除する事が出来るので、一番融通が利くとも言えます。