情報が少なすぎてコメントがつかないですね。使っておられるテーマと、トップページとして表示されているテンプレート（テーマ内のphpファイル）がどれであるかが判れば、コメントがもらえるかもしれません。
テンプレートファイルで、変数をひとつ作り、新着投稿を表示するループの外で初期化して、ループの中でインクリメントするのがシンプルでいいと思います。一般的なテンプレートなら、これでいけると思います。
$current_page = $paged ? $paged : 1;
$num_per_page = get_query_var('posts_per_page');
$number = ($current_page - 1) * $num_per_page + 1;
if ( have_posts() ) :
while ( have_posts() ) : the_post();
// ここで番号表示。マークアップはお好きに
echo '<h2>' . $number++ . '</h2>';
endwhile;
else :
// 投稿なし
endif;
どのファイルか、というのは、hironori1009 さんにしかわかりませんので、index.php か home.php の可能性が高い、としか言えません。
