複数投稿タイプ、の、一覧表示について

taxonomy.php の

<?php
    $args=array(
       'tax_query' => array(
            array(
                'taxonomy' => 'taxA1',
                'field' => 'slug',
                'terms' =>  'hoge'
           ),
        ),
        'post_type' => 'postA',
    ); ?>
    <?php query_posts( $args ); ?>

を削除し、taxA1、taxB1、taxC1のアーカイブを表示させた時、
（ダッシュボードの各タクソノミーのページから各タームの「表示」クリックで表示可能）
期待した投稿一覧になっているかどうか確認してください。

—

各タームは自動でアーカイブも作成されます。
ですので、一覧表示（アーカイブ）がいらないタームの場合は、別途コードを書かないといけません。
まずはアーカイブを表示させたいタームで意図した通りになるかどうかを確認してから、アーカイブのいらないタームの処理をした方が良いと思いますよー

ループ部分が表示されません（真っ白になります）。

他の部分（ヘッダーとかサイドバーとか）は正常に表示されていると言うことですか？

未検証ですが、taxonomy.phpは今のままで、
テーマのfunctions.phpに下記のコードを追加して、各タームのアーカイブを確認してみてください。

add_action( 'pre_get_posts', 'foo_modify_main_query' ); // pre_get_postsにフック
function foo_modify_main_query( $query ) {
  if ( is_admin() || ! $query->is_main_query() ) // 管理画面のときとメインクエリーじゃない場合は終了
    return;

  if ( $query->is_tax() ) { // タクソノミーアーカイブの時
    $query->set( 'post_type', 'any' ); // リビジョン以外の投稿タイプ全てを対象
    return;
  }
}

このコードを追加すると全てのカスタムタクソノミー（分類）の各タームのアーカイブにおいて、リビジョン以外の投稿タイプ全てが対象になるはずです。
ちょっとおおざっぱな指定をしてあります。

こちらでは確認できてます。
念のため、キャッシュ系のプラグインをはじめとして全てのプラグインをオフにして
（カスタム投稿タイプとカスタム分類をプラグインで作っているならそれのみ有効化して）
かつ、デフォルトテーマの functions.php にコードを追加して確認してみてください。

・taxonomy.phpにて、
termA11/termA12
termB11/termB12
termC11/termC12
に属する記事一覧を表示させたい。

http://example.com/?tax-a=term-a11,term-a12
http://example.com/?tax-b=term-b11,term-b12
http://example.com/?tax-c=term-c11,term-c12

何もしなくてもこんなURLで可能かと思います。

・各タームの記事を順番をランダムにしたい。

どうされたいのか、よく分かりません…