記事の表示について

記事数については、ループの前で条件を指定します。
例えば2010年9月すべての場合は、

query_posts('&year=2010&monthnum=9&showposts=-1');

showposts=-1 とすると管理画面で設定した記事数に関係なく
すべての件数を指定することになりますよ。

index.php （ですよね？）を以下のように記述すればOK。

<?php
get_header(); 

global $wpdb;
$results = $wpdb->get_results( "
  SELECT YEAR(post_date) AS year, MONTH(post_date) AS month
  FROM $wpdb->posts
  WHERE post_type = 'post' AND post_status = 'publish'
  GROUP BY YEAR(post_date), MONTH(post_date)
  ORDER BY post_date DESC
");
if ( isset( $_GET['myyear'] ) )
  $myyear = $_GET['myyear'];
else {
  if ( $results )
    $myyear = $results[0]->year;
  else
    $myyear = gmdate('Y', current_time('timestamp'));
}
if ( isset( $_GET['mymonth'] ) )
  $mymonth = $_GET['mymonth'];
else {
  if ( $results )
    $mymonth = $results[0]->month;
  else
    $mymonth = gmdate('m', current_time('timestamp'));
}

?><div id="container"><?php

$query = 'year=' . $myyear . '&monthnum=' . $mymonth . '&posts_per_page=-1';
query_posts( $query );
if ( have_posts() ) :
  while( have_posts() ) :
    the_post();
      /* ここら辺はお好みで。 */
      ?><h2><?php the_title(); ?></h2><?php
      ?><div><?php the_time( 'Y-m-d' ); ?></div><?php
      ?><p><?php the_content(); ?></p><?php
  endwhile;
endif;
wp_reset_query();  

if ( $results ) :
?><div class="pages"><?php
  $num = 1;
  echo '|';
  foreach ( (array) $results as $result ) {
    if ( $myyear != $result->year || $mymonth != $result->month ) {
      $page = '<a href="'
        . home_url( '?myyear=' . $result->year . '&mymonth=' . $result->month )
        .'">' . $num . '</a>';
    }
    else {
      $page = $num;
    }
    echo $page . '|';

    $num++;
  }
?></div><?php
endif;

?></div><?php

get_sidebar();
get_footer();
?>

※全体のマークアップその他は、ご自身のサイトに合わせてアレンジしてください。