テンプレートを編集するだけでは対応できないようです。
あくまで参考ですが、WP3.0.1の本体を見ますと、
wp-includes/comment-template.phpの1038行目あたり
function get_comment_reply_link($args = array(), $comment = null, $post = null) {
global $user_ID;
に続けて
global $user_level;
if( !$user_level >= 8 ) //ADMINISTRATOR = 8 / EDITOR = 3 / AUTHOR = 2 / CONTRIBUTOR = 1
return false;
を追加する、という方法はあります。
あくまで「できる」というだけで、適切な方法かと言えば、それはどうかなという感じですが。
テーマの functions.php に以下を追加すれば OK な気配◎
add_filter( 'comment_reply_link', 'my_comment_reply_link', 10, 4 );
function my_comment_reply_link( $link, $args, $comment, $post) {
if ( ! current_user_can( 'administrator' ) )
$link = '';
return $link;
}