アーカイブテンプレートに改行とリンクが反映されない

osamuyaさん、こんにちは。

loop.php の 137行目に以下の条件分岐があります。

<?php if ( is_archive() || is_search() ) : // Only display excerpts for archives and search. ?>

コメントの部分を訳すと「アーカイブと検索では、抜粋のみを表示する」ですね。
この条件分岐で使われている条件分岐タグ is_archive では、カテゴリーなども該当するため、the_excerpt で抜粋表示となり、改行などのタグが反映されなくなります。

single.php から呼び出されるのは、loop-single.php となるため、完全に同じにはなりませんが、この条件分岐を外して、142行目から、145行目の部分が適用されるようにすれば、トップページと同様の表示となります。

ただし、この方法ですと、Twenty Ten をそのまま改造してしまうことになるため、WordPress 本体をアップデートする際に、間違って上書きしてしまう可能性があります。

このような場合は、Twenty Ten をコピーして、style.cssのテーマ名を変更してしまうか、子テーマを利用すると良いと思います。