サブドメインにWP → 主ドメインをマルチサイト化

【サーバー】ロリポップ
【ドメイン】ムームードメイン
【主ドメイン】example.com （html手書き）
【サブドメイン】blog.example.com （WPインストール）（ディレクトリは「example.com/blog」）
【その他】Apacheで編集。phpmyadmin等の中身はイジれない。

現在、上記の様な状態です。
主サイトはexample.comでhtml。
サブドメインのblog.example.comには3.1.1のWPをインストールしてあります。
example.comをWP化したい。

WordPressのマルチサイト機能で複数のブログを管理するの「サブドメイン形式で複数のブログを管理する」を参考にblog.example.comの方でマルチサイト化を行ないました。

blog.example.comの方では閲覧・編集など、今まで通り問題なく使用できているのですます。が、主サイト example.comのダッシュボードを選択すると自分で設定した404.htmlへ飛んで編集のみできません。（閲覧は問題なし）

マルチサイトフォーラムを色々見てみましたが、DNS？を変更するしかないのでしょうか？？
もしくはexample.comにもWPをインストールし、blog.example.comをサブとしてマルチ化した方がいいのでしょうか？？