サブドメイン運用でカテゴリーが表示されない

バージョン3.2.1でサブドメインでの運用を始めました。

カテゴリーを登録するとDBには登録されます。（テーブル確認済）

投稿＞カテゴリーの画面では、XX項目と検索件数は表示されるも、「見つかりませんでした。」が表示されます。
また、投稿編集画面ではカテゴリー一覧に何も表示されません。

現在２サイト作成していますが両サイトとも同様の現象でカテゴリーが一切設定できない状態になっております。

対処法等ありましたら、よろしくお願いいたします。