サーバー移転後の固定ページ・投稿記事が表示されない件について

ロリポップ（Mysql5.6）から、さくらインターネット（Mysql5.5）にwordpressの移転作業を行いました。

データは画像、内容ともに移転が成功しましたが、表示の件で手間取っており、
色々と検索をかけたのですが、
その部分の知識が元々無いからなのか、全く理解が出来ていない状況です。

まず、管理画面にログインした状態では、
パーマリンクの設定がデフォルトでも、オリジナルでも表示が出来ますが、
ログアウトした状態ではトップページ以外表示がされない状況です。

パーマリンクの設定について
http://○○.sakura.ne.jp/%category%/%postname%.html
で表示をさせたいです。

.htaccessは、ロリポップからそのまま継続して使用しており、

# BEGIN WordPress
<IfModule mod_rewrite.c>
RewriteEngine On
RewriteBase /
RewriteRule ^index\.php$ - [L]
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d
RewriteRule . /index.php [L]
</IfModule>

# END WordPress

# BEGIN Lolipop [ http://lolipop.jp/manual/blog/wp-htaccess/ ]

# END Lolipop

# BEGIN Lolipop [ http://lolipop.jp/manual/blog/wp-htaccess/ ]

# END Lolipop

この中の、

RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d

を消してみたり、

# BEGIN Lolipop [ http://lolipop.jp/manual/blog/wp-htaccess/ ]

# END Lolipop

# BEGIN Lolipop [ http://lolipop.jp/manual/blog/wp-htaccess/ ]

# END Lolipop

を消したりすると、ページが崩れてしまいます…。

ちなみにまだ移転前のサーバーにはwordpressのデータが残っています。
これは、ドメインの付け替えをおこなったあとに、削除をする予定です。

いったい何が原因でこのような現象が起こっているのでしょうか…。

さくらインターネットにも問い合わせをしましたが、当然ながら対象外でサポート回答を得られませんでした。

HPの仕様
会員ページと一般ページと分けて運用しています。
（会員ページはオリジナルのid）を１つ発行し、投稿記事の閲覧をログインで見てもらいます。
一般用のページは全て固定ページで作成をしています。