ソースのインデント

テーマ作成した際にソースが汚かったので整えたいと思っています。
ソースのインデントについてですが、
wp_head()やget_template_part()、get_sidebar()、wp_nav_menu(array( ‘theme_location’ => ‘navigation’ ))などを使用した際にインデントされないのですがどうしたら良いでしょうか？

または無理なのでしょうか？