テンプレートタグ記述：「PHP 関数型引数のタグ」と「クエリ文字列型引数

WordPressに関しては１０月から始めた初心者です。
WordPressのテンプレートタグの記述には、「PHP 関数型引数のタグ」（ファンクション・スタイル）と「クエリ文字列型引数のタグ」（クエリー・スタイル）の２種類があるようです。

PHP 関数型引数のタグ記述例：
list_cats(TRUE, ‘All’, ‘ID’, ‘asc’, ”, TRUE, FALSE, FALSE,
TRUE, TRUE, FALSE, ”, ”, FALSE, ”, ”, ‘10,11,12’);
クエリ文字列型引数のタグ記述例：
wp_list_cats(‘exclude=10,11,12’);

Codex参考(テンプレートタグ/タグパラメータの渡し方)URL:’http://wpdocs.sourceforge.jp/%E3%83%86%E3%83%B3%E3%83%97%E3%83%AC%E3%83%BC%E3%83%88%E3%82%BF%E3%82%B0/%E3%82%BF%E3%82%B0%E3%83%91%E3%83%A9%E3%83%A1%E3%83%BC%E3%82%BF%E3%81%AE%E6%B8%A1%E3%81%97%E6%96%B9#.E3.82.AF.E3.82.A8.E3.83.AA.E6.96.87.E5.AD.97.E5.88.97.E5.9E.8B.E5.BC.95.E6.95.B0.E3.81.AE.E3.82.BF.E3.82.B0′

WordPress2.4.8を、ブログとしてではなく、通常サイトのCMSとして使用するためにカスタマイズする場合、テンプレートタグの記述には、「PHP 関数型引数のタグ」又は「クエリ文字列型引数のタグ」のどちらを使用するべきなのでしょうか（テンプレートタグがどちらでも使用できる場合）？

なお、「PHP 関数型引数のタグ」と「クエリ文字列型引数のタグ」の記述方法の違いについは自分で調べてだいたい分かりましたので、このスレではどちらの使用を推薦するかをお聞かせください。その他の記述方法等あれば、ヒントや解説等もお願いします。

よろしくお願いします。