トップページ以外がすべて404ページになってしまう

とても困っていて教えてください。

公開前のサイトなのですが、ホスティング会社のコントロールパネルから「アクセス制限」で、もともとかけてあったIDとPWを変更したところ、トップページ以外はすべて404ページになってしまいました。もちろんファイル自体はサーバにすべて残っていますし、ファイル名なども変えていません。突然の事態で途方に暮れています。

こちらのフォーラムの過去記事をチェックして、アクセス制限を一時解除してみたり、.htaccessと.htpasswdをFTPから削除してみたり、属性変更してみたり、そのほかキャッシュ削除などいろいろ試しましたが改善しません。WINのFF2、3、IE6、7すべて同じです。ホスティングはチカッパです。

最悪wordpressの再インストールも考えていますが少し億劫です。解決策がわかる方がいらっしゃれば助言をお願いします。