ヘッダーに出力されない

ヘッダーに下記の記述をしてアップロードしブラウザに表示したところmasonry.pkgd.min.jsの行だけブラウザに表示されていませんでした。
記述する行を上下しても結果は一緒でした。
プラグインを全部解除しても結果は一緒でした。
また、管理画面からテーマ編集の画面で見ると下記の記述はそのまま残っています。

<meta charset="<?php bloginfo ('charset') ; ?>" />
<link rel="stylesheet" href="<?php bloginfo ('stylesheet_url'); ?>" />
<!--[if lt IE 9]>
<script src="http://css3-mediaqueries-js.googlecode.com/svn/trunk/css3-mediaqueries.js"></script>
<![endif]-->
<?php
wp_deregister_script('jquery');
wp_enqueue_script('jquery', 'http://ajax.googleapis.com/ajax/libs/jquery/1.7.1/jquery.min.js', array(), '1.7.1');
?>
<?php wp_enqueue_script('masonry', get_bloginfo('template_url') . '/js/masonry.pkgd.min.js',array(jquery), '3.1.5'); ?>
<?php wp_enqueue_script('backstretch', get_bloginfo('template_url') . '/js/jquery.backstretch.min.js',array(jquery),'2.0.4'); ?>
<?php wp_enqueue_script('bxGallery', get_bloginfo('template_url') . '/js/jquery.bxGallery.min.js',array(jquery),'1.0.0'); ?>
<?php wp_enqueue_script('lightbox', get_bloginfo('template_url') . '/js/lightbox.min.js',array(jquery),'2.7.1'); ?>
<?php wp_head(); ?>

どのようなことが原因として考えられるのか教えていただけたら幸いです。