マルチサイトに独自ドメインをあてると500エラーになる

サーバー直下にインストールしたWPに、WordPress MU Domain Mappingを使用し、
マルチサイトにしました（サーバーの仕様上、独自ドメインはディレクトリに指定する必要があるためディレクトリ型での使用）
子サイトディレクトリへも問題なくドメインを当てれ、子サイト自体のWP動作も問題ありませんでしたが
WordPress MU Domain MappingのDomainsで独自ドメインと子サイトの紐付けを追加すると
ダッシュボードも記事・アーカイブもすべて500エラーになりました
ダッシュボードは自動的にhttp://独自ドメイン/wp-admin/になります

http://サーバ名/ディレクトリ/記事orダッシュボード
http://独自ドメイン/記事orダッシュボード
どちらも500エラーになります

.htaccessは以下のようになっています

RewriteEngine On
RewriteBase /
RewriteRule ^index\.php$ - [L]

# add a trailing slash to /wp-admin
RewriteRule ^([_0-9a-zA-Z-]+/)?wp-admin$ $1wp-admin/ [R=301,L]

RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} -f [OR]
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} -d
RewriteRule ^ - [L]
RewriteRule ^([_0-9a-zA-Z-]+/)?(wp-(content|admin|includes).*) $2 [L]
RewriteRule ^([_0-9a-zA-Z-]+/)?(.*\.php)$ $2 [L]
RewriteRule . index.php [L]

confingの追記部分は以下の通りです

define('WP_ALLOW_MULTISITE', true);
define('MULTISITE', true);
define('SUBDOMAIN_INSTALL', false);
define('DOMAIN_CURRENT_SITE', 'サーバー名');
define('PATH_CURRENT_SITE', '/');
define('SITE_ID_CURRENT_SITE', 1);
define('BLOG_ID_CURRENT_SITE', 1);

define( 'SUNRISE', 'on' );

原因がわからず困っています
どうぞよろしくお願い致します