メディアライブラリのサムネイルが表示されない

メディアライブラリを開いた時に表示される一覧のサムネイルが出なくなってしまいました。
メディアの中にはデータは入っていて、記事にも埋め込めますし、メディアからファイルの詳細を開けば画像も表示されるのですが、サムネイルだけが出てきません…

こうなった経緯は下記の通りです。
WPはマルチサイトで運営。
メインサイトを翻訳した英サイトを作ることになり、「MultiSite Clone Duplicator」というプラグインを使用してメインサイトをコピーしました。
複製がうまくいかなかったようで記事も何も入っていないサブサイトが出来てしまったので「ネットワーク管理」からサブサイトを削除したところデータベースが壊れてしまい、phpMyadminからデータベースをインポートして復旧を行いました。
この時点で記事は全て復旧していましたが、記事に埋め込んでいた画像は全て表示されず…
メディアを確認したところ、ファイル一覧はあるけれども画像がない状態。
FTPで/wp-content/uploads/を見てみるとファイルが全て消えていたので、メディアのパーマリンクに合わせたディレクトリにファイルをまるっとアップしました。
サイト上で確認したところ、記事の中に埋め込んだ画像は無事に復活しているのですが、メディアライブラリのサムネイルは灰色のままです。

「Add from server」などのFTPでアップした画像を認識させる形のプラグインを幾つか試してはみたものの、そもそもライブラリに登録されているデータなので再登録は出来ず…
他に、wp-config.phpにdefine(‘CONCATENATE_SCRIPTS’, false);と記述してみるのと、テーマを別のものに切り替えることはやってみましたが結果は効果なしでした。

幾つかアイキャッチ画像が外れていた記事があったのでファイル名で検索をかけてアイキャッチを設定し直したんですが、設定しなおした記事についてはキチンとアイキャッチのエリアにサムネイルが表示されているので機能が壊れた訳ではなさそうです…（やり直していない記事では透明になっています）

ファイル名で検索かければ挿入は出来るんですが、いかんせん使いづらいので、サムネイルを復活させたいのですが…何か方法はございませんでしょうか？
ご教示いただけますと幸いです。