ロリポップ（Lolipop）エコノミーのサブドメインにSQLite Integrationを使ってイ

はじめまして。ロリポップのエコノミーに、親サイトと子サイトを作ろうとしています。
親サイトはデザインの都合によりWordpressではなくBasercmsを入れ既に運用している状態です。
今まではサイトのルートフォルダ内にサブフォルダを作り、htmlで運用していたのですが、
ブログ形式にしたくなり、プラグインのSQLite IntegrationをWordpressに組み込んで
サブフォルダにFTPアップロードしてみたところ、インストール先にアクセスしても
「Internal Server Error」と出てしまいインストール画面が出ませんでした。
▼参考元サイト「WordPressをデータベース(MySQL)不要で、インストールして利用する方法」
http://9-bb.com/wordpress%E3%82%92%E3%83%87%E3%83%BC%E3%82%BF%E3%83%99%E3%83%BC%E3%82%B9mysql%E4%B8%8D%E8%A6%81%E3%81%A7%E3%80%81%E3%82%A4%E3%83%B3%E3%82%B9%E3%83%88%E3%83%BC%E3%83%AB%E3%81%97%E3%81%A6%E5%88%A9/

上手くいくと下記サイトの「設定ファイルを作成する」というボタンが出るようなのですが、
ルートフォルダにBasercmsを直接展開しているのがまずいのでしょうか。
▼「1つのSQLに複数のワードプレスを手動インストール（ロリポップ）」
http://sisutemuenjinia.com/wordpress/wpinstloli.html
（こちらのサイト様はデータベースありきの説明です。ロリポップのエコノミーはSQLiteのみ使用可になっています）

ちなみにルートフォルダには親サイト用の.htaccessが入っており、
Basercmsフォルダ内の親サイトルートフォルダへ転送がかかっています。
サブフォルダへの転送指示を別にかける事は可能でしょうか？
フォルダ構成を図式化すると下のような感じです。

親サイト—Basercmsフォルダ類
　　　　　 .htaccess、web.default.config 等、単独ファイル類
　　　　　 WordPressルートフォルダ（子サイト）—Wordpressフォルダ類
　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　 単独ファイル類（.htaccess無し）

パーマリンク設定未使用のため、現在Wordpressフォルダ内に.htaccessはありません。
ロリポップのコントロールパネルより、サブドメインのアップロード先フォルダ名は
指定してあります。

サイト内容自体訪問客が極端に少なく、更新頻度も低いためSQLiteに2つCMSを入れたいと思って
いますが、無理があるでしょうか？また、最終手段としてWordpressのテーマをBasercms用に
書き変える事も考えておりますが、なるべく避けたいと思っています。

何か手段等ご回答頂けましたら幸いです。