不動産プラグインの読み込み順番変更

不動産プラグイン：1.4.6
テーマ：twenty eleven
（初心者です。）

■経緯
　twenty elevenに不動産プラグインを適用すると、
　header、body、footerの一部がtwenty elevenのcssでは編集できなくなりました。
　Chromeのデベロッパー・ツールで編集先を確認したところ
　不動産プラグインの”fudou/themes/corners2011.css”でした。

○質問
　１、　そのまま後先考えず直接プラグインを編集してしまったのですが、
　　　　今後プラグインの更新等があった場合、上書きによって作り直しが
　　　　起こる？（起こりますよね？）を懸念しています。
　　　　これは読み込み順番を変更することで、twenty elevenのテーマから
　　　　読み込むことはできますか？その方法がわかりましたら教えてください。

　２、　プラグインの質問とは離れますが、Chromeのデベロッパー・ツールの使い方で
　　　　質問がございます。

　　　　・上部ウィンドタブelementsに表示されるファイルは複数の
　　　　　ファイルが混在したファイルを表示しているのでしょうか？
　　　　　表示されているファイルがどこのどのファイルかわかる方法はありますか？

　　　　・デベロッパーツール上に赤文字×マークで
　　　　　”uncaught TypeError: undefind is not a function”
と表示されています。定義されてない機能？ですかね？
　　　　　wordpress上にはエラーは表示されていません。
　　　　　調べてみましたが、解決しませんでした。
　　　　　もし、ご存じであればご教授ください。

以上、お手数をおかけいたしますが、よろしくお願いいたします。