移転後にサイト最上部に余白

サーバー移転後,wordpressのファイルは移転前のものを全てそのままアップロードしたのですが,移転前には存在しなかった謎の余白がサイト最上部に発生してしまいました。
wptouchプラグインを入れていますが,スマートフォンサイトでも余白が生じています。念のためwptouchプラグインを停止してみましたが,効果はありませんでした。
余白は全てのページで表示されているようです。
ブラウザはchrome,safari,IEで確認し、どれでも余白が表示されています。

類似した問題について検索しましたが,以下の作業を行なっても問題は解決しませんでした。

・管理バー
非表示にしても、ログインしていなくても余白が発生しました。

・ファイルに余計なスペースがないか?
テーマのheader.php,index.phpを確認してみましたが,ありませんでした。

・wp-footがない?
footer.phpにちゃんとあります。

・ob_end_clean()
テーマのindex.phpの最上部に記入してみましたが,余白は解消されませんでした。

この問題と関係があるかは分かりませんが,IEでサイトを見ると,一応テーマは適用されているのですが,レイアウトが崩れています。キャッシュを削除してもそのままでした。他のブラウザ(chrome,safari)では正常に表示されています。また,移転前はIEでも崩れていませんでした。