2つのタームで絞り込み、子ターム毎に記事を表示したい

店舗一覧のようなものを制作しており
お店のジャンル毎に、都道府県別の一覧を作りたいと考えています。
その一覧では、市・区毎に表示をしたいです。（市・区で分けない県もあります）

↓イメージ

東京都の八百屋（←お店のジャンルです）一覧

渋谷区
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お店１
お店２
お店５

新宿区
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お店３
お店６

世田谷区
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お店４

カスタム投稿（post_type：shop）を作成し
記事に、お店のジャンル（taxonomy：shop_cate）と都道府県（taxonomy：pref）のカテゴリをそれぞれ付けています。
市・区は、都道府県名を親に持つ子タームとして作っており、東京都と○○区のタームをつけます。

東京都
└渋谷区
└新宿区
└世田谷区
など

taxonomy-shop_cate.phpに↓のように

<li><a href="?pref=tokyo">東京都</a></li>
<li><a href="?pref=kanagawa">神奈川県</a></li>

パラメーターで都道府県を絞るリンクを設置し
ジャンル＋都道府県で絞った記事一覧を表示することはできたのですが
それを、市・区毎に表示する術がわからず…
お店のジャンルを無視すれば、市・区毎に表示する方法は見つけられたのですが
それ以上はうまくできず、お力をお貸しいただきたく書き込みさせていただきました。

何卒よろしくお願いいたします！