3.0.1にしたら nextpage （ページ分割）が動かなくなった

基本的なことですが、テーマをデフォルトに、プラグインを停止して確認していますか？

サイト運用中とのことですが、それは何か商用サイトの様な物ですか？だとしたらいきなり停止させるのは難しいかもしれませんが…個人サイトなら、1～2日程度のサイト停止は問題にならないと思います。とにかく今、問題が発生しており、それを速やかに解決する事を優先した方が良いと思います。

ただ…自分が1つ思い当たるのは、何か意図せずに「.htaccess」が新規に作成されてるのかも？？とりあえずFTPソフトなどでサイト全体を見回し、自分がUpした覚えのない「.htaccess」とか不審なファイルは無いか確認した方が良いかもです。その他に確認すべき点は、今現在、表示されているページを他のブラウザで動作確認。可能ならネット喫茶などの全く別の環境から見てみるとか。

とりあえず問題発生時の確認手順を書いてみましたので、参考にして調べてみて下さい。

＞STEP.1
WordPress本体は3.0.1のままで、
・全てのプラグインを停止
・テーマをDefaultに戻す
～以上の2つを必ず実行して、様子を見て下さい。
その結果、
・正常に動作 → STEP.2へ
・異常に動作 → WordPress本体がおかしい可能性！

＞STEP.2
テーマを海外の物に変更。
その結果、
・正常に動作 → STEP.3へ
・異常に動作 → そのテーマがWordPress3.0.1に対応していない？

＞STEP.3
一旦、テーマをDefaultに戻します。その後、プラグインを1個づつ有効化してみる。
尚、有効化は“1個づつ”が原則です！1個有効化して確認したら、それは停止して次のプラグインを有効化して様子を見ます。面倒ですが、必ずそうしないと原因が永久に分りません。
その結果、
・全て正常に動作 → STEP.4へ
・異常に動作 → そのプラグインがWordPress3.0.1に対応していない？

＞STEP.4
テーマを海外の物に変更し、再度STEP.3の手順を始めから行い様子を見ます（あくまでも“1個づつ”有効化です）。
その結果、
・全て正常に動作 → STEP.5へ
・異常に動作 → そのプラグインとテーマに相性問題あり？

＞STEP.5
テーマは海外の物のままで。再度STEP.3と同様の確認を行いますが、今度は1個づつ有効化していきながら、プラグインの有効化はそのままにして置きます。つまり最終的には全てのプラグインを有効化にします。
その結果、
・異常に動作 → そのプラグインとプラグインに競合問題あり？

＞テーマ自体が3.0.1非対応
WordPressのテーマはデザインだけを変えてる訳じゃないので、ままそういう事もあります。その辺の特性がMovableType派の人に嫌われる理由でしょうか…？

とりあえず原因特定が先決です。が…原因が特定出来ても、必ずしも不具合の改善が約束される訳では無いので、その辺はご理解と、それに最終的にはWordPress本体自体のver.をダウングレードする必要があるかもと言う事を肝に銘じて置いて下さい。

同じサーバー、同じテーマ、同じプラグイン使用で別のWordPressをインストールして同じ状態が発生するなら、それをテスト環境として原因を探ることもできますし、今後のバージョンアップや、新規プラグインの追加など、本番の環境でいきなり行うにはリスクの高いテストを事前に行うことができます。

当方は同じレンサバの同じプランを１つ別に契約していまして、非公開のテスト環境を構築しております。ローカルにもテスト環境を持っていて、ローカルでテストしたあと、非公開のテスト環境でテストし、本番環境に移行していく感じです。自作プラグインもこの環境でテストしていて、不具合が発生した場合もまずはテスト環境で修復を行います。

仮に、同じ環境で同じ不具合が発生しないとしたら、WordPressのファイルが一部破損した、もしくはDBのデータが一部破損したなど原因も考えられます。原因の簡易な切り分けにもなりますね。

仮環境は１つのサーバーでも構築可能です。その場合、可能であれば違うDBを使う方がより安全ですが、ご使用になっているサーバーの条件などでDBがもうひとつ作れない場合でも、接頭語を変えてインストールすれば2つのWordPressを共存させることは可能です。

ご参考になれば;)

こんにちは。私も同じ症状になりました。
私の場合は、パーマリンク設定をデフォルトに戻すことで直りました。
パーマリンク設定をカスタム構造にした場合、問題が発生するのではないかと思います。