ドメイン名が同じだったら使えます。
例えば、example.com に対する API Key を取得すれば、sub1.example.com や sub2.example.com でも使えます。
もし http://www.example.com で API Key を取得してしまうと、sub1.example.com では使えません。
「ドメイン名が同じだったら使え」て、異なると使えない、とのことですが、その根拠は何でしょうか?
APIキーをゲットする際に必要なのは、メールアドレスと、アカウント名、パスワードであり、ドメイン名に関して、何故このような制限が生じるのか、理解できないのですが…
疑問がある際一番早いのは提供元に問い合わせることです。wordpress.orgとは関係ないので。
WordPress.com の API キーはドメイン名がまったく違う場合でも複数のブログに対しても使えます。
うまくいかない場合は、以下からお問い合わせください。
http://en.support.wordpress.com/contact/