[Catch Box] サイトのタイトル位置の変更およびナビゲーションの背景色変更

ログイン後[設定]→[一般]、一般設定に入力した「サイトタイトル」を移動したいです。
現在、デフォルトで左側に表示されております。

ブログのトップページに表示されている[HOME]のリンク箇所がある
ナビゲーション部分の背景色を変更したいです。

[外観] > [Theme Options] の Custom CSS Styles で

#branding #access
#site-title
#branding ul.menu li

の CSS をお好みで指定してください。

[Catch Box] を使う場合TwentyTen、TwentyEleven、TwentyTwelveの中の
どれになるのでしょうか？

これはおっしゃっている意味がよくわかりません。Catch Boxは、独立したテーマなので、TwentyTen、TwentyEleven、TwentyTwelveのいずれとも異なります。