Custom Post Type Permalinksのタームを使ったパーマリンク

お世話になります。

カスタム投稿タイプのURLで
http://ドメイン/カスタム投稿タイプ名/ターム/スラッグ/
の形式のURLにしたく、管理画面上で

/%cus_sample（タクソノミー）%/%postname%/

にしたところ、URL自体は反映されたのですが、single-カスタム投稿.phpが適用されず、
index.phpが読み込まれてしまいます。
これをきちんとsingle-カスタム投稿.phpを読み込ませる方法を助言いただけないでしょうか？

書いているregister_post_typeの設定は下記の通りです。

register_post_type ( 'sample', array(
	'label' => 'カスタム投稿',
	'labels' => array(
		'name' => 'カスタム投稿',
		'singular_name' => 'カスタム投稿',
		'add_new_item' => '記事を追加',
		'new_item' => '記事',
		'view_item' => '記事を表示',
		'not_found' => '記事は見つかりませんでした',
		'not_found_in_trash' => 'ゴミ箱に記事はありません。',
		'search_items' => '記事を検索'
	),
	'has_archive' => true,
	'public' => true,
	'show_ui' => true,
	'taxonomies' => 'cus_sample',
	'query_var' => true,
	'rewrite' => true,
	'hierarchical' => false,
	'exclude_from_search' => false,
	'menu_position' => 5,
	'supports' => array(
		'title','editor','excerpt',
		'revisions','thumbnail','author'
	),
) );