footer.phpについて

footer.phpに初期値で入力されているテーマやdvdcopyへのリンクを非表示にしてコピーライトなどを表示したいのですが,footer.phpだけがbase64_decodeというものから始まり暗号化されており、意味がわかりません。

それは悪意あるコードを埋め込まれた危険なテーマの可能性が大です。即刻、他の安全なテーマ (WordPress デフォルトの Default テーマ) に変更し、wp-config.php などが書き変わってないか検査してください。「WordPress 2.8.5: 強化リリース」で紹介された WordPress Exploit Scanner を使うのもよいでしょう。

現在使っているテーマの名前は何で、どこから入手されたものでしょうか? 他の人が同じテーマを使わないために、入手先の URL を教えてください。

例外なく「base64_decode()」のようなコードが含まれるテーマは使ってはいけません。このようなコード難読化の手法は、オープンソースの理念に反するものであり、セキュリティー的にも問題が大きいため、排除されなければなりません。