ktai style　過去アーカイブから特定カテゴリを排除したい

ktai styleを使わせていただいてます。

現在、PC版では月刊アーカイブ(archive.php)の表示箇所で、

$wp_query->query_vars[‘category__not_in’] = array(表示したくないカテゴリID);
とした後でquery_postsをして、表示したくないカテゴリを排除しています。

ただ、同じ事をk-tai styleのテーマにarchive.phpを配置して行おうとすると、指定したカテゴリの記事は表示されないものの、月別にソートされずに常に新しい記事順でソートされています。

ソースを自分なりに追っかけてみたものの、どこでクエリが作られているのか分からず、行き詰ってしまいました。

もし同じような件を解決された方がいらっしゃれば、どこを見れば良いかヒントをいただけないでしょうか？
宜しくお願いします。