Ktai Styleで個別ページ以外にcanonicalが出てこない

IKEDA Yurikoさんこんにちは。
rel=’canonical’についての確認させてください。
<link rel=’canonical’ href=’*********’ />

個別ページ(single.php)では、きちんとhead内に表示されているようなのですが、それ以外のページで表示されてきません。

・/wp-includes/default-filters.phpにはきちんと定義されているので、wordpressのバージョンの問題ではなさそう。
・remove_actionはしていない
・add_actionでrel_canonicalも試してみました。

他にどのような原因が考えられるでしょうか？
ちなみに、ことの発端というのは、
http://＊＊＊＊＊.com/?menu=tag
http://＊＊＊＊＊.com/?img=link
というのが携帯のgooの検索エンジンにインデックスされ始めたことによります。
この問題を解決すべくcanonicalを調べてみたら上記のような症状でした。

ちなみに、きちんと表示される個別ページはhead内に以下が表示されます。
<link rel=’index’ title=’＊＊＊’ href=’＊＊＊’ />
<link rel=’prev’ title=’＊＊＊’ />
<link rel=’canonical’ href=’＊＊＊’ />

それ以外ではrel=indexしか表示されていません。
<link rel=’index’ title=’＊＊＊’ href=’＊＊＊’ />

あやしそうなのは、ks_reject_pc.phpかなと思っているのですが詳しくわかりませんでした。
どうかよろしくお願いします。

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WordPress 2.9.2
Ktai Styleバージョン 2.0.0（ケータイサイトとして使用）