PCサイトとスマホサイトでページ数が違う場合

行いたいことは、以下のようになるかと思います。

以下、２点の条件を満たした場合にトップページへとリダイレクトさせる。

1. PCサイトである（PCのテーマが適用されている）
2. 下層ページへのアクセスである

１つめの条件については、PCテーマの functions.php にフックの記述を行えば、PCサイトの場合のみ適用されるようになります。
※ PCとスマホで、子テーマの機能を使っている場合は注意が必要です。

２つ目の条件については、他にページが一切存在しない場合は、

! is_front_page()

でトップページ以外の判定が可能です。

リダイレクトさせるタイミングですが、一般的には、template_redirect を利用するのが良いでしょう。