phpmyadminでのデータベースのバックアップに関して

データベースのバックアップをしたいのですがうまくいかなくて困っています。
今までは定期的に（週一回くらい）phpmyadminでデータベースをエクスポートしていたのですが、最近急にできなくなりました。
プラグインでもバックアップしようとしたのですがどれもうまくいきませんでした。
WordPress 3.5.1
PHP version 5.3.22
MySQL version 5.1.70-cll
phpMyAdmin　バージョン情報: 4.0.5
もしかしたら、データベースのサイズが40MBなのでタイムアウト扱いになっているのかもしれん。
今までgzip圧縮しないとエクスポートできませんでした。
phpMyAdminがバージョンアップしてから？エクスポート画面で以下の注意書きが出るようになりました。
This interface does not work with large databases or large tables. Please see phpMyAdmin bug 4046.
つまり、データベースのサイズが大きいのでphpMyAdminではバックアップできないということなのでしょうか？

やりたいことはデータベースのバックアップなのでphpMyAdmin以外の方法でも構いません
ご助言いただけると助かります。よろしくお願いいたします。