こんにちは。Standard Widget Extensions 作者です。
サイドバーとメインカラムには ID 属性がついていない場合は、テンプレートをカスタマイズして ID 属性をつけてあげる必要があります。ざっと見ただけですが MH Magazine lite の場合、サイドバーは「class=”sidebar」と「class=”hp-sidebar」で検索してマッチした箇所に id=”mysidebar” などと追加すればよさそうです。メインカラムは「class=”content」を検索してマッチした箇所がそうです。
ちなみに、テーマの要素を分析するにはブラウザについてくる開発者用の要素検証ツールを使うと良いと思います。例えば Chrome ならばコンテキストメニュー (Windows 右クリック) から「要素を検証」を選びます。既にご存じならば失礼しました。