twenty twelve 子テーマ作成で wedget-area・・・困った

2カラムで
左（コンテンツ）
<div id=”primary” class=”site-content”>
と
右（ウィジェットエリア）
<div id=”secondary” class=”widget-area” role=”complementary”>
が横並びになっていたのですが、

突然、とんでもなく壊れてしまい、どうしようもなくなってしまいました。
どこか、重要なタグを消してしまったのか？
作業2日前のバックアップなどにファイル全体を上書きしてみたのですが、直りません。

2カラムに関係のありそうな<DIV>タグに色をつけて原因を見てみようと・・・
.widget-area{background-color: #F69;}
として色をつけてみても、色もつかないような状態です。

http://elinked.sub.jp/
上記にてtwenty twelve　の子テーマとして作成中です。

topはsidebar_top.php　（http://elinked.sub.jp/
他は sidebar.php　（http://elinked.sub.jp/?cat=73

違うphpファイルを利用していて、サイト全体のレイアウトが崩れてしまったので他のファイルが原因でしょうか？
壊れたときの記憶としてはやはり外観＞ウィジェットやsidebar.php辺りを触っていたような記憶です。

大変困ってます。よろしくお願いいたします。