WP-PageNaviで、ページングはできるが同じ記事が重複して表示される

お世話になります。お知恵をお借し頂きたいです。
WP-PageNaviを使用して、search-[カスタム投稿名].php　にて検索結果を3件ずつ表示しようとして以下の症状が出ました。

■導入前
カスタム投稿の中から、検索した記事を全て表示することができることを確認。

■PageNaviを使うにあたって行ったこと。
①Wordpressの「表示設定」にて 1ページに表示する最大投稿数 を「1件」に設定
②ページ番号が取得できるように、$pageをquery_postsに設定。
③wp_reset_query をループ処理終了後に実行

■WP-PageNavi導入後の症状

• ①ページ送りはできるが、同じ記事が違うページに出力される
  　ただ、全ページの記事の合計は検索ヒット時の件数と同じ＝表示されない記事があるということ。
• ②ページ１＞ページ２＞ページ１　と遷移すると、ページ１に表示される記事が変化する。

■ページの表示に使っている処理
●前処理
　`<?php
query_posts( array(
‘meta_query’ => $metaquerysp,　　//query_postにmeta_query(検索条件)を入力
‘s’ => $s,
)
);
?>`
>検索条件を配列で$argに格納したところから開始。
●search-[カスタム投稿名].php
`<?php
parse_str( $query_string, $args );　//ページ本来の情報を取得
global $wp_query;
$args = array_merge( $wp_query->query_vars, array( ‘post_type’ => ‘カスタム投稿名’,’posts_per_page’ => 2, ‘paged’ => $paged,’orderby’ => ‘rand’));
query_posts( $args );
?>`
>検索件数を表示
<?php if (have_posts()) : ?>
<p><?php echo $wp_query->found_posts; ?>件の記事が見つかりました。

>検索結果を表示
<?php while (have_posts()) : the_post(); ?>
<div class=”box1″>
<?php echo $post->post_title; ?>
</div>
<?php endwhile; ?>
<?php else: ?>
<p>記事はありません</p>
<?php endif; ?>
<?php wp_pagenavi(); ?> //WP-PageNavi表示
<?php echo $paged; ?> //ページ番号取得ができているか確認のため
<?php wp_reset_query(); ?> //

$page　関数の操作には問題がないが、ページごとの記事の出力に問題があるという状態です。

上記現象の原因について、ご教授頂けますでしょうか。
宜しくお願い致します。