wp_nav_menuをヘッダーやサイドバーで使う際の分岐について

functions.phpにて、class My_Walker_Nav_Menu extends Walker_Nav_Menuの設定で、ナビゲーションのデフォルト時の挙動を調整しているのですが、「wp_nav_menu」を使うと同じcssやjavascriptが干渉してしまうので、置き場所（ヘッダーやサイドバー）によって条件分岐は可能でしょうか？
wp_nav_menuのtheme_locationでの変更ができれば良いのですが、いまいちわからなくて…。
宜しくお願いします。