Astaire

chestnut_jp さん

そうなんですよね、かなりグダグダな質問文でした、失礼しました。

インストールと設定は、以下のサイトを参考にしました（以下のサイトでインストールしているのはバージョン 3.0 系、私がインストールしたのは 3.1.4 ですが大きな違いはないと考えています）。
http://wpgogo.com/customize/wordpress-multisite-multiple-domains.html

サブドメイン型でマルチサイトを構築して、その段階では閲覧も管理画面に入ることもできます。
ですが url を独自ドメインにすると、閲覧はできるのですが管理画面にログインできなくなります。
環境を壊してしまったので正確な url を示せないのですが、id/passwod をいれてログインボタンをクリックすると、
http://example.com/wp-login.php?=redirect_to=http(://がurlエンコードされた文字列) example.com/…reauth=1
に飛ばされていました。

ちなみに debug は on にしましたが特にエラーは吐き出されていませんでした。