上記自己解決できました！
http://www.adphic.jp/wp/templatetag-tips/tips-include/
上記記事を参考に、この場合子カテゴリはcategory.phpのテンプレートに適応されてしまっているのでcategory.phpのhead内に下記を記述したらそれぞれの子カテゴリが属する親カテゴリのテンプレートに変更することができました。
<?php if(in_category(‘親カテゴリID’))
{ include (TEMPLATEPATH . ‘/適応させたい親カテゴリ.php); return; }
?>
おさわがせいたしました。
