ありがとうございます。
記述に間違いはないと思います。。。
最初に書きましたが、
2)404エラーになるリンク先は、
http://example.com/wp-admin/network/
です。
これを手入力で
http://example.com/wp/wp-admin/network/
に変更すると、ネットワーク管理者のダッシュボードは表示されます。
なので、Wordpressのリンクだけがおかしいように感じています。
が、どうしても修正できなかった&過去にも同様の質問が未解決で残っていたため、インストールディレクトリとサイトURLを同一にして対応しました。
解決済みにはせずに残しておきます。
いろいろとありがとうございました。
はい、index.phpと.htaccessはドメイン直下にあります。
ご回答ありがとうございます。
example.comでアクセスはできており、そのダッシュボードもアクセスできています。
ネットワーク管理者のダッシュボードのみが正しくないURLになっているようです…。